Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Syce1lQ5D525 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Syce1lQ5D525 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms