Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp13Q5BKP2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp13Q5BKP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms