Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Spsb3Q571F5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spsb3Q571F5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spsb3Q571F5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms