Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ddx49Q4FZF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx49Q4FZF3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms