Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Brinp3Q499E0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brinp3Q499E0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brinp3Q499E0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brinp3Q499E0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brinp3Q499E0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms