Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1nQ497L1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al1nQ497L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms