Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt35Q497I4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms