Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430531B16RikQ3V2J1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
6430531B16RikQ3V2J1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms