Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap1-4Q3V2D6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms