Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd5Q3V1H9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Samd5Q3V1H9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Samd5Q3V1H9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms