Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc110Q3V125 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc110Q3V125 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms