Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc185Q3V118 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc185Q3V118 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc185Q3V118 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms