Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ankrd53Q3V0J4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd53Q3V0J4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd53Q3V0J4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms