Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrfip1Q3UZ39 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrfip1Q3UZ39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms