Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc160Q3UYG1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc160Q3UYG1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms