Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mbd3l2Q3UXB0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3l2Q3UXB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms