Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prom2Q3UUY6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prom2Q3UUY6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prom2Q3UUY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prom2Q3UUY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prom2Q3UUY6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prom2Q3UUY6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prom2Q3UUY6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms