Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-Eb2Q3UUV9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms