Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ScimpQ3UU41 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ScimpQ3UU41 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms