Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
B230104I21RikQ3USW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B230104I21RikQ3USW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B230104I21RikQ3USW4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms