Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nhlrc4Q3UP44 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nhlrc4Q3UP44 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms