Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cracr2aQ3UP38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cracr2aQ3UP38 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cracr2aQ3UP38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms