Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNW5

Tfcp2l1, Transcription factor CP2-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2l1Q3UNW5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tfcp2l1Q3UNW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tfcp2l1Q3UNW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfcp2l1Q3UNW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms