Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrch2Q3UMG5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrch2Q3UMG5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrch2Q3UMG5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms