Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp19Q3UJD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp19Q3UJD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Usp19Q3UJD6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms