Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sf3b2Q3UJB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sf3b2Q3UJB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sf3b2Q3UJB0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms