Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnep1r1Q3UJ81 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnep1r1Q3UJ81 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms