Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc34Q3UI66 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc34Q3UI66 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms