Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp36Q3UFY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrp36Q3UFY0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms