Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam35aQ3UEN2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam35aQ3UEN2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam35aQ3UEN2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms