Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trafd1Q3UDK1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trafd1Q3UDK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms