Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Parp8Q3UD82 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Parp8Q3UD82 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Parp8Q3UD82 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms