Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VwceQ3U515 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VwceQ3U515 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VwceQ3U515 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms