Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ssbp4Q3U4B1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms