Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud5Q3U2S4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud5Q3U2S4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud5Q3U2S4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms