Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec24aQ3U2P1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sec24aQ3U2P1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sec24aQ3U2P1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms