Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Serac1Q3U213 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Serac1Q3U213 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Serac1Q3U213 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms