Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Palb2Q3U0P1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Palb2Q3U0P1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Palb2Q3U0P1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms