Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0I6

Smim6, MCG148180, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim6Q3U0I6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim6Q3U0I6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim6Q3U0I6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smim6Q3U0I6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms