Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXZ1

Znf575, Zinc finger protein 575, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf575Q3TXZ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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Znf575Q3TXZ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf575Q3TXZ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf575Q3TXZ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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Znf575Q3TXZ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Znf575Q3TXZ1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf575Q3TXZ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms