Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Ccdc136Q3TVA9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ccdc136Q3TVA9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms