Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTJ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3TTJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTJ4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms