Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Calr4Q3TQS0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Calr4Q3TQS0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Calr4Q3TQS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms