Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtf3c3Q3TMP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gtf3c3Q3TMP1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf3c3Q3TMP1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms