Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uri1Q3TLD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uri1Q3TLD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uri1Q3TLD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms