Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Smarca4Q3TKT4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Smarca4Q3TKT4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Smarca4Q3TKT4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Smarca4Q3TKT4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Smarca4Q3TKT4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms