Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde12Q3TIU4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde12Q3TIU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde12Q3TIU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms