Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trappc13Q3TIR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc13Q3TIR1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trappc13Q3TIR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms