Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEL6

Rnf157, E3 ubiquitin ligase Rnf157, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf157Q3TEL6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf157Q3TEL6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf157Q3TEL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf157Q3TEL6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms