Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hddc2Q3SXD3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hddc2Q3SXD3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hddc2Q3SXD3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms